Помощь по Теле2, тарифы, вопросы

§ 74. Транскрипция иностранных слов 1. В любом языке, помимо исконных слов и освоенных заимствований, используются слова и сочетания, сохраняющие свой иноязычный облик и воспринимающиеся как вкрапления из других языков. Они могут оформляться как латиницей alma mater, так и

Транскрипция

Транскрипция Транскрипция (лат. Transscriptio, грамм.) – письменное изображение звуков и форм известного языка, обладающего или не обладающего собственной системой письма, при помощи письменной системы, обычно данному языку не свойственной и принадлежащей какому-нибудь

Транскрипция

Транскрипция Транскрипция – переложение вокального или инструментального сочинения на фортепиано. Т. должна быть сделана так, как будто сочинение написано специально для фортепиано. Лист первый стал писать Т. и нашел многих подражателей. Капитальным трудом в области Т.

Транскрипция (в биологии)

Транскрипция (в музыке)

Транскрипция (переписывание)

ТРАНСКРИПЦИЯ – ИГРА

ТРАНСКРИПЦИЯ – ИГРА Будем различать две вещи. С одной стороны: общую тенденцию реабилитировать забытые принципы музыки прошлого, тенденцию, которая проходит через все творчество Стравинского и его великих современников; с другой стороны: прямой диалог, который ведет

ТРАНСКРИПЦИЯ-ИГРА У КАФКИ

ТРАНСКРИПЦИЯ-ИГРА У КАФКИ До чего странный роман - Америка Кафки: в самом деле, почему этот молодой двадцатидевятилетний прозаик перенес действие своего первого романа на континент, где никогда не бывал? Этот выбор показывает ясное намерение: не создавать реализм; или

Транскрипция в биологии - это многоступенчатый процесс считывания информации с ДНК, который является составляющей Нуклеиновая кислота является носителем генетической информации в организме, поэтому важно правильно ее расшифровать и передать другим клеточным структурам для дальнейшей сборки пептидов.

Определение «транскрипция в биологии»

Синтез белка является основным жизненно важным процессом в любой клетке организма. Без создания молекул пептида невозможно поддержание нормальной жизнедеятельности, т. к эти органические соединения участвуют во всех процессах метаболизма, являются структурными компонентами многих тканей и органов, играют сигнальную и регулирующую и защитную роли в организме.

Процесс, с которого начинается биосинтез белка, и есть транскрипция. Биология кратко разделяет его на три этапа:

1. Инициация.
2. Элонгация (нарастание цепи РНК).
3. Терминация.

Транскрипция в биологии - это целый каскад пошаговых реакций, в результате которых на матрице ДНК синтезируются молекулы РНК. Причем таким образом формируются не только информационные рибонуклеиновые кислоты, но также транспортные, рибосомальные, малые ядерные и другие.

Как и любой биохимический процесс, транскрипция зависит от множества факторов. Прежде всего, это ферменты, которые отличаются у прокариот и эукариот. Эти специализированные белки помогают инициировать и проводить реакции транскрипции безошибочно, что важно для качественного получения белка на выходе.

Транскрипция прокариот

Так как транкрипция в биологии - это синтез РНК на матрице ДНК, то в этом процессе главным ферментом является ДНК-зависимая РНК-полимераза. У бактерий существует только один вид таких полимераз для всех молекул

РНК-полимераза по принципу комплиментарности достраивает цепь РНК, используя матричную цепь ДНК. В составе этого фермента есть две β-субъединицы, одна α-субъединица и одна σ-субъединица. Первые две составляющие выполняют функцию образования тела фермента, а остальные две отвечают за удержание фермента на молекуле ДНК и узнавание промотерной части дезоксирибонуклеиновой кислоты соответственно.

Кстати, сигма-фактор служит одним из признаков, по которым распознается тот или иной ген. Например, латинская буква σ с индексом N означает то, что эта РНК-полимераза узнает гены, которые включаются при недостатке азота в окружающей среде.

Траскрипция у эукариот

В отличие от бактерий, у животных и растений транскрипция происходит несколько сложнее. Во-первых, В каждой клетке находятся не один, а целых три вида разных РНК-полимераз. Среди них:

1. РНК-полимераза I. Она отвечает за транскрипцию генов рибосомальных РНК (исключение составляет 5S РНК субъединицв рибосомы).
2. РНК-полимераза II. Ее задача состоит в синтезе нормальных информационных (матричных) рибонуклеиновых кислот, которые в дальнейшем участвуют в трансляции.
3. РНК-полимераза III. Функция этого вида полимераз заключается в том, чтобы синтезировать а также 5S-рибосомальную РНК.

Во-вторых, для узнавания промотора у эукариотических клеток недостачно иметь только полимеразу. В инициации транскрипции также участвуют специальные пептиды, которые называются TF-белками. Только с их помощью РНК-полимераза может сесть на ДНК и начать синтез молекулы рибонуклеиновой кислоты.

Значение транскрипции

Молекула РНК, которая образуется на матрице ДНК, впоследствии присоединяется к рибосомам, где с нее считывается информация и синтезируется белок. Процесс образования пептида очень важен для клетки, т.к. без этих органических соединений невозможна нормальная жизнедеятельность: они в первую очередь являются основой для важнейших ферментов всех биохимических реакций.

Транскрипция в биологии - это еще и источник рРНК, которые а также тРНК, которые участвуют в переносе аминокислот во время трансляции к этим немембранным структурам. Также могут синтезироваться мяРНК (малые ядерные), функция которых заключается в сплайсинге всех молекул РНК.

Заключение

Трансляция и транскрипция в биологии играют исключительно важную роль в синтезе белковых молекул. Эти процессы являются основной составляющей центральной догмы молекулярной биологии, которая гласит о том, что на матрице ДНК синтезируется РНК, а РНК, в свою очередь, является основой для начала формирования молекул белка.

Без транскрипции невозможно было бы считать информацию, которая закодирована в триплетах дезоксирибонуклеиновой кислоты. Это еще раз доказывает важность процесса на биологическом уровне. Любая клетка, будь она прокариотическая или эукариотическая, должна постоянно синтезировать новые и новые молекулы белка, которые нужны в данный момент для поддержания жизнедеятельности. Поэтому транскрипция в биологии - это основной этап в работе каждой отдельной клетки организма.

Транскрипция — процесс синтеза РНК с использованием ДНК в качестве матрицы, что происходит во всех живых клетках, то есть, это перенос генетической информации с ДНК на РНК.

В случае ДНК, кодирующего белок, транскрипция является первым шагом биосинтеза белков, процесса, который в конечном счете приводит к переводу генетического кода, через мРНК как промежуточного звена, в полипептидную последовательность функционального белка.

Транскрипция катализируется ферментом ДНК-зависимой РНК-полимеразы. Процесс синтеза РНК протекает в направлении от 5"- к 3"конца, то есть РНК-полимераза движется матричным цепочкой ДНК в направлении 3 "-> 5".

Уровень транскрипции большинства генов четко регулююеться с помощью факторов транскрипции. Именно на этом этапе происходит большая часть регуляции экспрессии генов.

Обычно процесс транскрипции делится на 4 стадии — пре-инициацию, инициацию, элонгацию и терминацию.

Транскрипционные фабрики Транскрипция осуществляется в так называемых «транскрипционных фабриках» (Cook PR, Science 1 999 1 999 Jun 11, 284 (5421): 1790-5 The organization of replication and transcription.). 8 РНК II полимеразы составляют основу этого огромного комлекса и организуют компактизации хроматина в ядре клетки. Визуализация сайтов транскрипции возможна с помощью бромоуридину in vivo и последующей иммунодетекциею флуоресцентно замеченными антителами.

Основные процессы

Транскрипция делится на пре-инициацию, инициацию, промоторной очистки, элонгацию и терминацию. Участок ДНК, на которой происходит синтез РНК носит название — транскриптон.

Пре-инициация

В эукариот: РНК-полимераза, а следовательно и инициация транскрипции, требует наличия промоторной последовательности. Промотор — участок ДНК, запускает транскрипцию и (у эукариот) находится в 30, 75 и 90 нуклеотидных пар до точки начала транскрипции. Факторы транскрипции — белки, связывающиеся с промоторной последовательностью и способствуют началу полимеризации РНК.

Инициация

У прокариот транскрипция начинается с связывания РНК-полимеразы с промотором. Прокариотическая РНК-полимераза содержит 5 субъединиц: 2 α субъединицы, 1 β субъединицы, 1 β"субъединицы и 1 ω субъединицы — вместе эти субъединицы образуют ядро ​​фермента (core). В начале инициации энзим связан с σ-фактором, который помогает находить нужные -35 и -10 точки впереди промоторной последовательности. Сочетание РНК-полимеразы с σ-фактором носит название голофермент.

В эукариот инициация гораздо более сложный процесс. Екуриотична РНК-полимераза не распознает промотор. В свою очередь, группа белков, названных факторами транскрипции, соединяются с промотором и только после этого РНК-полимераза "садится" на цепь ДНК формируя комплекс инициации транскрипции.

В археи транскрипция происходит подобно эукариот.

Промоторной очистки

Только первый связь синтезированы, РНК-полимераза должна очистить Промотер от факторов транскрипции. В этот промежуток времени фермент синтезирует короткие ("усеченные") куски РНК. Этот процесс называется оборвана ("абортивная") инициация и он общий для прокариот и эукариот.

У прокариот, оборвана инициация продолжается пока не будет синтезирован цепь РНК с пороговой длиной в 10 нуклеотидов, после чего промотор освобождается от комплекса инициации и формируется комплекс элонгации. σ-фактор отсоединяется от РНК-полимеразы по стохастической модели. Промотор отсоединяется благодаря "скрипящему" механизма, который обеспечивает накопление необходимого количества энергии путем псевдосинтезу РНК при оборванной инициации и разрыв связей между голоферментом и белками на промоторе.

В эукариот, после нескольких циклов 10-ти нуклеотидной оборванной инициации происходит промоторной очистки, совпадает с фосфорилированием серин-5 С-концевого домена РНК-полимеразы II в. Это приводит к запуску энзима кепування мРНК (англ. MRNA-capping enzyme). Точный механизм, которым этот фермент индуцирует промоторной очистки в эукариот до сих пор не объясним.

Элонгация

Одна цепь ДНК — матричная нить (или некодирующих нить), становится матрицей для синтеза РНК. Только начинается транскрипция, РНК-полимераза перемещается матричной нитью и, используя свойство комплементарности оснований, строит на ДНК-матрице РНК копию. Хотя РНК-полимераза проходит матричной нитью от 3 "→ 5", кодирующая нити и вновь РНК также могут быть использованы в качестве опорных точек, так что транскрипция может быть описана так, будто бы происходит в направлении 5 "→ 3". Это приносит молекулу РНК точной копией кодирующего цепи (за исключением того, что тимин заменен урацилом, и нуклеотиды состоят из рибозы, тогда как в ДНК — дезоксирибоза).

Транскрипция мРНК може втягивать несколько РНК-полимеразы в едином матрице ДНК и продолжаться циклически (амплификация частей мРНК), так что с одной копии гена можно быстро синтезировать много молекул мРНК.

Элонгация также включает в себя корректирующий механизм, который может заменить неправильно включены основы. В эукариот, он может отвечать коротким паузами во время транскрипции, позволяющие связываются с новосинтезированные цепью соответствующим факторам редактирования РНК. Эти паузы могут возникать также из-за особенности действия РНК-полимеразы или через структуру хроматина.

Согласно принципу последовательности, информация переносится от ДНК к РНК и белкам: ДНК -> РНК -> белок. В связи с этим обратимся к содержанию транскрипции (от лат. transcriptio - переписывание), наряду с репликацией ДНК являющейся важнейшим генно-молекулярным механизмом. Транскрипция во многом похожа на репликацию, но, разумеется, у нее есть и многочисленные особенности. Одна из них состоит в том, что при выяснении содержания транскрипции непременно необходимо учитывать строение генов. Дело в том, что в репликации воспроизводятся все структурные единицы генов, чего нет при транскрипции.

Традиционно ген определяется как единица наследственной информации, детерминирующая выполнение организмом определенной функции. Ген состоит из регуляторной и кодирующей части. Транскрибируется только кодирующая часть, которая состоит из экзонов и нитронов. Такая транскрипция характерна для незрелой РНК. Она находит свое продолжение в окончательной стадии транскрипции, при которой из незрелой РНК исключаются все интроны, а оставшиеся экзоны объединяются. В месте промотора с регуляторной частью гена связывается РНК-полимераза, которая в результате инициирует начало транскрипции на одной из двух цепей ДНК. На рис. 6.8 представлена схема устройства гена эукариотов, а также зрелой и незрелой РНК.

Некоторые из использованных выше терминов, очевидно, нуждаются в характеристике.

Рис. 6.8.

Промотор (от фраиц. promoteur - основатель, инициатор) - это последовательность нуклеотидов ДНК, которая позволяет регулировать экспрессию генов. Он находится около 5"-гена и, следовательно, непосредственно перед той частью гена, которая кодирует РНК. Существенным признаком промотора является его специфическое взаимодействие с ДНК зависимыми белками, которые посредством РНК-полимеразы определяют начало транскрипции. Такие белки называются факторами транскрипции.

Наряду с промотором к регуляторной части гена относятся последовательности нуклеотидов, которые также оказывают существенное влияние на экспрессию генов. Энхансеры (англ, enhancer - усилитель, увеличитель) ее усиливают, а сайленсеры (от англ, silencer - глушитель) подавляют, но не сами по себе, а лишь в случае воздействия на них факторов транскрипции. Пространственное положение энхансеров и сайленсеров не является четко определенным, они могут находиться на меньшем или большем расстоянии от промотора.

Экзон (англ, expressed region - область выражения) - участок гена, кодирующий зрелую РНК и белки. Экзоны являются первичными генетическими единицами, от которых решающим образом зависит облик всего биологического мира. Именно их перекомбинация приводит к образованию новых генов и белков. Всего лишь 1,5% генного состава ДНК определяет синтез белков. Другая часть этого состава либо вообще не транскрибируется, либо определяет строение таких разновидностей РНК, например транспортных РНК, которые не обладают функцией синтеза белков.

Интрон (от англ, intervening regions - промежуточные области) - участок гена, который не содержит информации о зрелых РНК и белках. Биологические функции интронов изучены значительно хуже, чем функции экзонов. Большие споры вызывает также вопрос об их происхождении: то ли они возникли вместе с прокариотами, то ли вместе с эукариго- тами или же даже позже их. В одном гене человека в среднем содержится 8,8 экзона и 7,8 ингрона, но ингроны в среднем приблизительно в 25 раз длиннее экзонов .

После сказанного нетрудно представить в себе в основных чертах весь процесс транскрипции (рис. 6.9).

Рис. 6.9.

Этап инициации. Под воздействием ферментов, в частности энхансеров, присоединившись к промотору, РНК-полимераза разрывает азотистые основания (указаны на рис. 6.9 вертикальными короткими линиями) и выбирает ту ветвь ДНК, которая становится матрицей транскрипции (на рис. 6.9. это нижняя линия). Она также создает глазок транскрипции (на рис. 6.9. это треугольная крышечка). При этом для этапа элонгации обнажается 10-20 пар неклеотидов. Интересно, что в случае транскрипции нет необходимости в формировании праймера, характерного для процесса репликации ДНК. Транскрипция обходится без праймера.

Этап элонгации. Под действием РНК-полимеразы в области транскрипционного глазка формируется РНК. В отличие от ДНК-полимеразы РНК-полимераза не способна корректировать правильность синтеза РНК-цепи и исправлять допущенные ошибки. Если в процессе синтеза возникают затруднения, то движение РНК-полимеразы приостанавливается. В результате вероятность ошибочной сборки РНК снижается. Транскрипция не прекращается, глазок удаляется от промотера. В тех областях, которые миновал глазок, восстанавливается дуплексная структура ДНК. Цепь синтезируемой РНК постепенно удлиняется. Она растет в направлении 5"-3".

Этап терминации. Он наступает в силу воздействия на РНК-полимеразу вспомогательных факторов. Как только область транскрипции достигается экзонуклеазами, транскрипция прекращается, а РНК-полимераза и РНК отделяются друг от друга. ДНК полностью восстанавливает свою дуплексную структуру.

Информация обо всех разновидностях РНК содержится в ДНК. Впрочем, не все они транскрибируются непосредственно на матричной ДНК.

Некоторые РНК являются модификациями ранее транскрибированных РНК. Для нас, знакомящихся с основаниями молекулярной генетики, наибольший интерес представляют РНК, участвующих непосредственно в синтезе белков. Их всего 5 типов (табл. 6.4).

Таблица 6.4

РНК, участвующие в синтеза белков

* Информационная РНК - то же самое, что матричная РНК; ** SPR - сокр. англ. signal recognition particle - частицы, распознающие сигналы.

Транскрипция всех РНК происходит иод действием определенных РНК-полимераз или их сочетаний. В табл. 6.5 приведены основные три типа РНК-полимераз.

Таблица 6.5

Типы РНК-полимераз

’ Малые (короткие) РГК отличаются от длинных РНК. Микро РНК являются разновидностью малых РНК, которые составляют 98% всего рибонуклеотидного материала.

В заключение параграфа отметим, что наряду с прямой транскрипцией возможна и обратная. Способностью транскрибировать РНК в ДНК обладают ретровирусы, в частности ВИЧ, ответственный за СПИД. Ретровирус встраивается в клетку. Специальный фермент обратная транскриптаза осуществляет транскрипцию РНК -» ДНК. Затем на полученной цепи ДНК как на матрице достраивается вторая цепь ДНК. После чего реализуется цикл ДНК -> РНК -» белки. Некоторые эукариоты содержат фермент теломеразу, которая также инициирует обратную транскрипцию. Феномен обратной транскрипции должен учитываться при формулировке принципа последовательности. Он не должен интерпретироваться в качестве отрицания обратной транскрипции.

• Ген состоит из регуляторной и кодирующей части.
• Кодирующая часть гена включает экзоны и нитроны.
• Интроны не транскрибируются в зрелую РНК.
• Транскрипция включает этапы инициации, элонгации и терминации.
• Существуют различные типы и виды как PIIK, так и РИК-полимераз транскрипции.
• Синтез любой РНК осуществляет либо одна, либо несколько полимераз, причем нс без участия белковых ферментов.

• SakharkarM. К., Chow V. Т., Kangueane Р. Distributions of Exons and Introns in the HumanGenome //In Silicio Biology. 2004. Vol. 4. No. 4. P. 387-393.